FSC認證的費用取決于以下幾個因素：
①認證面積。一般地說，林地面積越大，認證費越高，但認證費并非成正比例的增加，通常申請認證的林地面積越大，則單位林地面積的平均認證費越少，因此營林者應盡可能一次性地將符合條件的林地都包含進去，以降低認證成本。切忌一小塊一小塊地分開認證。
②位置的分布是分散還是集中。林地越分散，審核人員需要去看的地方越多，路程和時間都會比較多，因此費用自然比較高。
③認證公司的遠近。認證機構如果遠隔重洋，認證人員到達現場的差旅費自然高很多。現在在國內并沒有認證公司的常設機構，相對近一些的也只有一些認證公司設在亞洲國家的分支機構。
④認證隊伍中外國專家的人數。認證隊伍中的外國專家主要來自于歐美等發達國家，他們工資水平高出幾個數量級，而且他們從國外到達林地現場的交通費用也高很多。國內專家的報酬則低很多。因此認證隊伍中有一個外國專家或兩個外國專家對認證費的影響是很大的。
⑤認證公司期望賺取的利潤。這方面的差距惟有進行多方面比較才能得出。
一般地，FSC/COC認證的總費用在三到十萬左右。具體視公司規模、銷售額、人員數量，現場數量等因素決定。
企業實施FSC(COC)認證所必須的程序和記錄
●記錄并使員工理解主要活動的程序文件和工作指導；
●記錄并維護足夠的主要活動及生產過程的記錄；
●記錄材料采購與供應商選擇的程序文件；
●足夠標識采購的材料的記錄：材料來源、材料類型、特點、數量、 證書號碼等等；
●對采購和加工材料進行物質識別使認可與非認可來源的材料容易區別；
●標識方法通常運用顏色代號或特殊標記與：條形碼、儲存卡、工作卡、批量卡等等的組合；
●認可和非認可來源材料的應被物理隔離以防止混合；
●材料須在生產系統階段中所有階段被隔離
●圓木、批量木材、木材堆等須有獨一無二鑒別(號碼)用于追溯材料來源；
●追溯性須貫穿于材料的采購，加工及最后產品裝船的過程；
●記錄涉及認可木材使用的生產過程的程序文件與工作指導；
●保存每一批認可材料精確的生產記錄；
●用認可材料生產的產品須清楚標明并與用非認可材料生產的產品隔離；
●記錄處理，儲存，包裝和發貨的程序文件；
●許可材料和非法可材料分開儲存；
●包裝和標識認可產品以確定材料來源的狀態；
●根據認證管理規定做許可產品的標記；
●規定人員的職責；
●對人員作充分的職務培訓。
