在重慶注冊醫療器械公司，需要按照以下步驟進行：
前期準備：
①確定公司名稱：準備 5 個以上公司備選名稱，以便核名時使用。
②準備注冊地址證明：如果是自有房產，需提供房產證及房主身份證復印件；如果是租賃的房產，需提供房屋租賃合同以及房產證復印件。
③明確股東信息：確定公司的股東、法人、監事等人員信息，并準備好他們的身份證原件或復印件。
④確定經營范圍：明確公司主要經營的醫療器械類別和具體產品范圍，有的范圍可能涉及到辦理資質或許可證。
⑤確定注冊資本：根據公司的經營需求和實際情況確定注冊資本金額，并注明股東的出資比例及出資期限。
工商注冊：
①核名：登錄重慶市的企業登記注冊相關系統，進行網上核名，也可以前往當地G商局窗口進行核名申請。
②提交材料：核名通過后，在線或前往G商局窗口提交工商注冊材料。
審核與領取營業執照：工商部門對提交的材料進行審核，審核通過后，領取公司的營業執照（三證合一）。
辦理醫療器械經營許可證或備案：
①一類醫療器械：如果只經營一類醫療器械，相對簡單，只需在營業執照的經營范圍中添加醫療器械經營類目即可。
②二類醫療器械：需要辦理備案手續。在食品藥品監督管理局網站上提交申請，審核通過后，頒發《第二類醫療器械經營備案憑證》。
③三類醫療器械：需要辦理《醫療器械經營許可證》。準備相關申請材料，將申請材料提交到當地食品藥品監督管理部門，部門會對申請材料進行審核，并可能進行現場核查。審核通過后，頒發《醫療器械經營許可證》。
需要注意的是，具體的注冊流程和要求可能會因地區、經營類型等因素有所不同，建議在注冊前詳細咨詢當地的市場監督管理部門和食品藥品監督管理部門。
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