生物醫學工程將工程原理和設計理念運用于醫學和生物學。利用工程與生命科學研究相結合的跨學科方法來提高醫療診斷、監控和治療過程的水平。您所面臨的最大挑戰是了解材料表面如何與生物組織發生相互作用，例如：如何最大限度地減小植入物的排斥反應。

由于采用了跨學科的方法，因此顯微鏡和顯微鏡解決方案能夠覆蓋很寬的應用范圍，如使用體視顯微鏡完成制備任務和處理微小物體。使用光學顯現鏡對金屬和與生物材料直接接觸的化合物的表面及成份進行研究。如果需要知道細胞內功能的相互作用，則可以使用熒光顯微鏡檢測熒光蛋白發出的信號。電子顯微鏡能提供材料表面的高分辨率圖像信息及亞細胞結構的超微成像。關聯光學和電子顯微鏡（CLEM）解決方案 Shuttle & Find 功能是組合各層信息的必備工具。

生物醫學工程的這一分支領域涵蓋制造過程中的所有質保程序。所有植入物需要依照標準程序和法律規定進行檢驗。顯微鏡與自動測量程序能提供用于記錄組件質量的所有數據。標準化的校準程序可確保產品在其生命周期內的一致性。卡爾·蔡司研制的專業儀器和基礎設施平臺能幫助完成質保與質檢流程。