高效液相色譜儀的系統由儲液器、泵、進樣器、色譜柱、檢測器、記錄儀等幾部分組成。儲液器中的流動相被高壓泵打入系統，樣品溶液經進樣器進入流動相，被流動相載入色譜柱(固定相) 內，由于樣品溶液中的各組分在兩相中具有不同的分配系數，在兩相中做相對運動時，經過反復多次的吸附- 解吸的分配過程，各組分在移動速度上產生較大的差別，被分離成單個組分依次從柱內流出，通過檢測器時，樣品濃度被轉換成電信號傳送到記錄儀，數據以圖譜形式打印出來。
高效液相色譜儀的正確安裝事項如下：
1、要注意防止灰塵玷污光學元件
該儀器很多檢測器都是屬于光學類的分析儀器，這些光學元件很容易受到灰塵玷污，光學元件一旦被玷污，就會引起很多麻煩。與光學元件受潮后效果一樣，主要是使光學元件的反射率降低，從而影響儀器的靈敏度。另外，還會使得雜散光增大，噪聲增大，減低檢測器的靈敏度，使得分析測試的誤差增大。因此，安放本該儀器的房間要干凈、通風、防塵，同時還要注意防止震動。
2、要注意防止干擾。
要注意防止電、磁場的干擾。電、磁場的干擾是影響高效液相色譜儀穩定性的重要因素。一般來講，安放該儀器的房間，應該遠離電場、磁場干擾。
3、要注意防濕防潮
本儀器是光、機、電、計算機四位一體的、技術密集的高科技產品，它的每一個部分都不允許受潮。否則，將會使有關的元器件損壞或性能變壞，影響儀器的穩定性。
注：使用高效液相色譜儀時，液體待檢測物被注入色譜柱，通過壓力在固定相中移動，由于被測物種不同物質與固定相的相互作用不同，不同的物質順序離開色譜柱，通過檢測器得到不同的峰信號，最后通過分析比對這些信號來判斷待測物所含有的物質。高效液相色譜作為一種重要的分析方法，廣泛的應用于化學和生化分析中。高效液相色譜從原理上與經典的液相色譜沒有本質的差別，它的特點是采用了高壓輸液泵、高靈敏度檢測器和高效微粒固定相，適于分析高沸點不易揮發、分子量大、不同極性的有機化合物。
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