氫氧焊機在具有多種功能應用的同時，也存在一些局限性：
一、應用材料的局限性
材料兼容性
氫氧焊機主要適用于焊接金屬材料，如碳鋼、不銹鋼等。對于一些特殊的金屬合金，其焊接效果可能會受到影響。例如，對于某些高溫合金，氫氧焊接過程中可能會導致合金元素的燒損，改變材料的原有性能。這是因為氫氧火焰的溫度和化學活性在焊接這些復雜合金時，無法像專門為其設計的焊接方法那樣準確控制。
對于非導電材料，如陶瓷、塑料等，氫氧焊機幾乎無法進行焊接。因為氫氧焊接是基于電弧產生高溫使金屬熔化實現焊接的過程，這些非導電材料不能形成焊接回路，無法利用氫氧焊機進行有效焊接。
二、焊接環境的局限性
對通風要求高
氫氧焊機在工作過程中會產生氫氣和氧氣的混合氣體。氫氣是一種易燃易爆氣體，在焊接現場如果通風不良，氫氣積聚可能會引發爆炸危險。因此，焊接工作須在通風良好的環境中進行，這在一定程度上限制了其在封閉或通風條件差的場所的應用，如一些地下建筑或狹窄的船艙內部等。
對濕度敏感
氫氧焊機的焊接質量可能會受到環境濕度的影響。在高濕度環境下，焊接過程中容易產生氣孔等缺陷。因為水分可能會混入焊接區域，在高溫作用下變成水蒸氣，形成氣孔，影響焊接接頭的質量和強度。所以，在濕度較大的環境中使用氫氧焊機，需要采取額外的除濕措施，這增加了焊接的復雜性和成本。
三、焊接精度和復雜形狀的局限性
精度控制難度較大
相比一些高精度的激光焊接設備，氫氧焊機在焊接微小或精密部件時，精度控制相對困難。氫氧焊接的火焰和熔池較大，對于一些要求微米級精度的電子元件焊接等精細工作很難勝任。例如，在焊接微小的電路板線路時，氫氧焊機很難將熱量準確地集中在需要焊接的微觀區域，容易造成相鄰元件的損壞。
復雜形狀焊接受限
當面對具有復雜幾何形狀的工件時，氫氧焊機的應用也會受到限制。由于氫氧焊接主要依靠火焰熔化金屬，對于一些內部有復雜空腔、凹陷或者是具有多層結構的工件，很難保證焊接質量均勻一致。例如，在焊接具有復雜內部通道的金屬模具時，氫氧焊機可能無法將熱量均勻地傳遞到各個需要焊接的部位，導致焊接不完整或者出現應力集中的情況。
四、設備穩定性和便攜性的局限性
設備穩定性依賴外部條件
氫氧焊機的工作性能在很大程度上依賴于氣體供應系統的穩定性。如果氫氣和氧氣的供應壓力、流量等參數不穩定，會影響焊接火焰的質量，進而影響焊接效果。而且，氫氧焊機的電氣系統也需要穩定的電源供應，在電源波動較大的環境中，可能會出現電弧不穩定等問題，降低焊接質量。
便攜性不足
氫氧焊機通常需要配備氫氣和氧氣發生器或者氣瓶，這些輔助設備使得整個焊接系統相對笨重。與一些小型的、便攜式的焊接工具（如手持式電容儲能焊機）相比，氫氧焊機在野外作業或者需要頻繁移動工作地點的情況下，便攜性較差。這限制了它在一些搶修、戶外建筑等場景下的快速部署和使用。